Играем по второму сезону: Наступило временное затишье. Никто не жаждет войны. Но опытные ниндзя чувствуют неладное. В тоже время в Конохе появляются весьма подозрительные личности, напоминающие Акатцук. Цунадэ решает устроить слежку за ними и узнать, что понадобилось им в Конохе. А сами Акатцуки наблюдают за Наруто, увидев это, один из шпионов докладывает об этом 5 - ой хокаге. Им нужен Наруто, точнее девятихвостый лис внутри него - об это Цунадэ знала давно, но внезапно происходит самое невероятное... Они похищают Сакуру! И требуют отдать Наруто взамен. Кажется, Акатцуки догадались о слабом месте парня.
  Наруто не выдерживает и отправляется вслед за Акатцуками, по пути он случайно встречает Саске. После долгого разговора между парнями, Саске решает помочь Наруто спасти Сакуру, тайно замышляя убийство Итачи. Орочимару разгневан внезапным уходом Саске и хочет вернуть его обратно, но Кабуто отгаваривает его, потому что если Орочимару отправиться за Саске, он встретит Акатцук, не он и не они не желают встретиться вновь. И Орочимару решает направить шпиона, но Саске не станет доверять ниндзям Ото вновь, поэтому он решает сделать шпионом его бывшую ученицу - Анко… Он отправляется в Коноху, его присутствие никто не замечает, ведь жители обеспокоены за Наруто, и они посылают вслед за ним другие команды, а также о потери узнают в селении Песка, Гаара немедленно покидает Суну и отправляется на помощь к Наруто вместе с Темари, Канкуро и Матсури.
  Сакура пытается сбежать из штаба Акатцук, но у нее ничего не выходит, вместо этого она влюбляется в одного из членов организации - Дейдару. Но пока знает об этом лишь она сама.